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7种作物叶绿体基因的密码子偏好性及聚类分析
研究作物叶绿体蛋白编码基因的编码特点,对指导农作物的叶绿体基因工程研究设计,促进外源基因在受体作物中的高效、稳定表达具有重要作用.为此,综合运用了多种分析软件,对7种大田作物的叶绿体蛋白编码基因进行分析.结果表明:叶绿体蛋白编码基因的总碱基构成在7种作物中差异不大,都是A含量最高,而G,C的含量较低;但在密码子第3位的碱基构成上却有明显差别,3种双子叶作物偏爱以C,T结尾的密码子,而禾本科的4种作物则偏爱以T,C结尾的密码子;RSCU(同义密码子的相对使用度)值显示出禾本科作物有26个密码子具有偏好性,而双子叶作物有25个密码子具有偏好性,但二者之间有22个相同的偏好性密码子.基于RSCU值的聚类结果显示,植物的密码子偏好性具有种族特征,表明基于叶绿体蛋白编码基因的密码子使用特性的聚类结果可以作为系统发育分析的重要补充.晁岳恩,常阳,王美芳,何盛莲,赵献林,雷振生 - 华北农学报文章来源： 万方数据 -
玉米烟嘧磺隆敏感基因的遗传分析及基因定位
磺酰脲类除草剂烟嘧磺隆由于低用量、低毒、广谱及使用方便等特点而被广泛使用.对包括Wny-1和yn-6在内的81个玉米自交系进行烟嘧磺隆敏感性试验,并以Why-1和yn-6为亲本进行烟嘧磺隆敏感性遗传研究.通过Wny-1和yn-6杂交、回交得到F1、BC1群体,进而分析烟嘧磺隆敏感性遗传规律;利用BC1群体中的烟嘧磺隆敏感单株对该敏感基因进行SSR标记定位.结果表明,81个玉米自交系中有8个敏感,73个耐烟嘧磺隆;yn-6对烟嘧磺隆的敏感性由1对隐性核基因控制,该基因位于第5染色体短臂上5S-96和5S-78标记之间,物理距离约为0.18 Mb,暂时将该基因命名为nsfy.洪翠萍,韩帅,张彦军,王立静,魏海忠,钟世宜,刘保申 - 华北农学报文章来源： 万方数据 -
内膜肉瘤是最常见的原发性心脏肉瘤:100例原发性心脏肉瘤临床病理及分子病理的回顾性分析
观察100例原发性心脏肉瘤的分子及病理组织学特征-其中内膜肉瘤是最常见的类型.通过免疫组化、荧光原位杂交、实时聚合酶链反应和阵列比较基因组杂交技术对1977~2013年初法国病理部门存档的年龄从18~82岁(平均年龄50岁)的65例女性和35例男性患者的原发性心脏肉瘤的资料分析后发现:右心和左心肉瘤分别为44例和56Neuville A,Collin F,Bruneval P,许春伟,张立英 - 临床与实验病理学杂志文章来源： 万方数据 -
千里光肌动蛋白基因(Actin)的生物信息学及功能分析
肌动蛋白(Actin)是广泛存在于高等植物中的组成型表达蛋白质,与细胞分裂、细胞运动、细胞信号转导等功能密切相关.为明确肌动蛋白性质与功能的关系,本研究从千里光全长cDNA文库中分离得到Actin基因.序列分析结果表明:该基因长度为1 481 bp,编码360个氨基酸残基的多肽,与甘草Actin基因编码的氨基酸序列(GenBank登录号:ABW71681.1)的同源性最高,达96%;预测蛋白质的分子量为40.02 kDa,理论等电点为5.85;结构分析发现,螺旋结构和无规则卷曲构成Actin二级结构的主要组分;三级结构预测发现,Actin具有4个结构域;蛋白系统发生树发现,与甘草和鹰嘴豆的亲缘关系较近.本研究认为,高等植物Actin可能参与基因的转录调控,其氨基酸突变位点未对功能结构域产生影响.张珍,平军娇,蔡振锋,汤贤春,钱刚 - 植物研究文章来源： 万方数据 -
猪圆环病毒2型河南株全基因组的克隆与序列分析
利用PCR方法,对河南郑州、南阳、焦作等地采集的疑似猪圆环病毒2型(PCV2)感染的病料进行检测.PCR检测为阳性的病料经处理后,接种无PCV污染的PK-15细胞中盲传6代,克隆11株PCV2全基因组并进行序列分析.结果表明,11株PCV2中有10株基因组全长为1 767bp,基因组分型为PCV2b,1株为1 768bp,说明PCV2b是河南省断奶后多系统衰竭综合征(PMWS)发生的主要因素;11个毒株的同源性位于94.9%~100%,与其他毒株的同源性为94.7%~100%;10株基因组为1 767bp的毒株处于一大分支上,遗传进化比较稳定;本试验为PCV2在河南地区的分子流行病学、遗传变异及防治奠定了基础.王亚丹,卢权威,陈红英,崔保安,王淑娟,朱前磊,王子馨,钞安军 - 中国兽医学报文章来源： 万方数据 -
恙虫病东方体合肥分离株截短56 kDa蛋白抗原表达及活性分析
本文获得恙虫病东方体合肥分离株截短56 kDa外膜蛋白基因工程纯化抗原,并鉴定其免疫学活性,为进一步研制广谱诊断试剂、疫苗以及分析其在东方体致病的分子机制奠定基础.我们通过DNAStar和Mega等软件对含有440个氨基酸的合肥株56 kDa蛋白序列进行抗原性分析;将合肥株56 kDa截短蛋白基因克隆至原核表达载体pET28a获重组质粒,转入大肠杆菌E.coli BL21感受态中,经IPTG诱导,SDS-PAGE电泳分析检测蛋白表达;采用亲和层析法纯化目的蛋白,Western-blot及ELISA法鉴定其免疫学活性.序列分析发现合肥分离株56 kDa蛋白可分为4个保守区和3个可变区,抗原性分析结果显示,其保守区的亲水性和抗原性均有很高峰值.SDS-PAGE电泳显示约56 kDa的目的重组蛋白表达条带,Western-blot分析显示该重组蛋白可与恙虫病病人血清反应,阴性血清则未出现相应印迹,ELISA分析结果显示该蛋白最低浓度为80 ng/μL时仍可检出阳性血清;5μg/mL蛋白可检测阳性血清滴度高达1∶12 800,证实其具有较强反应原性.本实验获得恙虫病东方体合肥株56 kDa截短外膜蛋白基因工程抗原具有良好的抗原活性,有望进一步应用于恙虫病的诊断、疫苗研制及致病机制分析.耿美玲,郑峰,吕恒,朱进,胡丹,郝丽娜,张凤玉,龚秀芳,李丙军 - 寄生虫与医学昆虫学报文章来源： 万方数据 -
食管鳞状细胞癌基因组改变的确认
食管癌是最具侵袭性的癌症之一,居全球恶性肿瘤病死率的第六位.全球约70%的食管癌患者在中国,食管鳞状细胞癌是最常见的病理类型(>90%).目前,临床上对于食管鳞状细胞癌的早期诊断和治疗非常有限,患者5年生存率仅为10%.然而,直到目前对于导致食管鳞状细胞癌发病的完整基因组事件仍知之甚少.本组对158例食管鳞状细胞癌病例进行一次全面的基因组分析:其中17例食管鳞状细胞癌病例进行全基因组测序,71例进行外显子测序,在崔淼,许春伟(摘译),张博(审校) - 临床与实验病理学杂志文章来源： 万方数据 -
禾谷缢管蚜水通道蛋白基因RpAQP1的克隆、分子特性和表达分析
为探究禾谷缢管蚜Rhopalosiphum padi(Linnaeus)水通道蛋白基因Rp AQP1的序列特征及其在不同龄期的表达,利用RT-PCR和RACE技术克隆了Rp AQP1基因的c DNA全序列,采用生物信息学软件分析了Rp AQP1编码蛋白的特性,利用qRT-PCR分析了Rp AQP1在不同龄期的表达量.结果显示:禾谷缢管蚜水通道蛋白基因Rp AQP1的c DNA全长为1 216 bp,其750 bp的开放阅读框编码250个氨基酸,蛋白分子量为27.36 k D.Rp AQP1属于水通道蛋白亚家族DRIP(果蝇内嵌蛋白Drosophila integral protein)的一员,具有6个跨膜区,2个保守的NPA结构单元和1个压缩区域Ar/R;qRT-PCR结果显示,Rp AQP1在整个发育历期均有表达,其在2龄若蚜中表达水平最高,是成蚜表达量的1.432倍;在4龄若蚜中表达量最低,为成蚜表达量的0.444倍,显著低于其它龄期,而其余各龄期Rp AQP1表达量无显著差异.左亚运,李晓叶,李玉婷,王康,乔宪凤,陈茂华 - 植物保护学报文章来源： 万方数据
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