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血浆中多基因联合甲基化检测在肺癌诊断中的应用
目的:探究血浆中CDH13、RASSF13A、DLEC13、SEPT13、RUNX13等抑癌基因启动子甲基化及其联合检测在肺癌诊断中的价值。从中选出诊断效能高的组合。方法:采用巢式甲基化特异性PCR( nest methylation specific PCR,nMSP)法,检测106例健康人血浆样本、106例肺癌组织和癌旁组织以及其对应的106例术前血浆样本、中基因启动子区的甲基化状态。对血浆基因组DNA修饰后进行多重置换扩增( multiple displacement amplifica-tion, MDA),以解决血浆DNA模板不足的问题。结果:肺癌组织样本中的CDH13、RASSF13A、DLEC13、SEPT13、RUNX13基因启动子甲基化率分别为51.9%、44.3%、54.7%、36.8%、24.5%。对应的血浆样本中的 CDH13、RASSF1A、DLEC1、SEPT9、RUNX3基因启动子甲基化率分别为46.2%、41.5%、50.9%、31.1%、19.8%。 Kappa一致性检验结果表明肺癌组织与血浆的甲基化检出率一致。 CDH13、DLEC1、RASSF1A、SEPT9组合对肺癌的诊断效能明显高于其它组,准确度ACC为82.08%, Youden指数为0.6415(灵敏度为79.49%,特异度为81.13%)。结论:血浆多基因联合甲基化检测有望应用于肺癌早期诊断。丁浩,沈志高,李昊,邱宇,郝晓宁,祖金池,钟理 - 中国病理生理杂志文章来源： 万方数据 -
肿瘤中DNA甲基化对miRNA调控作用的研究进展
miRNA的异常表达与肿瘤的发生、发展密切相关,但miRNA的表达调控机制目前尚不清楚。有研究提示,在肿瘤细胞中DNA 甲基化异常会引起 miRNA 的表达改变,即DNA甲基化程度的改变将促进或抑制miRNA的表达,从而抑制或促进肿瘤的发生、发展。因此,DNA甲基化对miRNA的调控作用已成为肿瘤相关研究领域中的“新大陆”。该文就DNA甲基化调控miRNA的表达并参与人类肿瘤发生、发展的有关研究进展作一综述。顾页,林洁 - 临床与实验病理学杂志文章来源： 万方数据 -
RKIP基因启动子甲基化与胃癌侵袭转移及预后的关系
目的 探讨胃癌组织中RKIP基因启动子甲基化情况与胃癌生物学行为及其预后的关系.方法 采用甲基化特异性PCR(methylation-specific PCR,MSP)技术检测98例胃癌组织及癌旁正常胃黏膜组织中RKIP基因启动子甲基化情况;Kaplan-Meier法评估胃癌患者术后5年生存率;COX比例风险模型分析RKIP基因启动子甲基化对患者预后的影响.结果 胃癌及癌旁正常胃黏膜组织中RKIP基因启动子的甲基化阳性率分别为45.9%和4.1%(P<0.05);RKIP基因启动子甲基化与胃癌分化程度、UICC分期及淋巴结转移有关(P<0.05).RKIP基因启动子甲基化阳性组患者5年生存率(20.56%)显著低于阴性组(60.38%)(P<0.05);RKIP基因启动子甲基化是胃癌患者的独立预后因素.结论 RKIP基因启动子的异常甲基化与胃癌的发生、发展、侵袭、转移有关,其可作为预测胃癌患者预后的生物学指标.李冬霞,千智斌,李永真,李巧香 - 临床与实验病理学杂志文章来源： 万方数据 -
结直肠癌中miR-200家族启动子甲基化状态分析
目的检测HCT116、HT29、LS174t、SW480、SW620和LoVo细胞中miR-200家族启动子甲基化状态,分析其与结直肠癌临床分期、分化程度及预后的相关性;同时进行miR-200家族甲基化程度与患者生存相关性分析.方法重亚硫酸盐测序法(bisulfite genomic sequence PCR,BSP)检测6株不同恶性程度的结直肠癌细胞株中miR-200家族启动子甲基化程度;分析其甲基化程度与细胞恶性程度、miR-200a表达量的相关性.甲基化特异性(methylationspecific PCR,MSP)技术检测138例结直肠癌组织中miR-200家族启动子甲基化程度.结果 6株不同恶性程度的结直肠癌细胞株中miR-200家族启动子甲基化程度不同,且其甲基化程度与细胞恶性程度成反比,与细胞株中miR-200a表达量的检测结果一致.结直肠癌组织中miR-200家族启动子甲基化程度与患者年龄无关,与患者性别、肿瘤最大径、淋巴结转移及远处转移、患者术后生存时间相关.结论 miR-200家族的表达受甲基化修饰的调控,且该调控成为影响表达量的主要原因.miR-200家族甲基化程度与结直肠癌患者生存期密切相关,可作为预后指标.何楠,吴共发,赵海燕,赖伟男,韩慧霞 - 临床与实验病理学杂志文章来源： 万方数据 -
胃癌组织中RKIP基因启动子甲基化及蛋白表达
目的:探讨胃癌组织中RKIP基因启动子甲基化及蛋白的表达,分析RKIP基因启动子甲基化及蛋白表达与胃癌生物学行为的关系。方法采用甲基化特异性PCR( methylation-specific PCR, MSP)技术和免疫组化SP法检测45例胃癌组织、21例癌旁胃黏膜组织中RKIP基因启动子甲基化及蛋白的表达。结果胃癌及癌旁胃黏膜组织中RKIP基因启动子的甲基化阳性率分别为48.89%和4.8%(P<0.05);RKIP蛋白在胃癌及癌旁胃黏膜组织中的阳性率分别为42.22%和90.48%(P<0.05);RKIP基因启动子甲基化及蛋白的表达分别与胃癌的分化程度及淋巴结转移有关( P<0.05)。 RKIP基因启动子甲基化与蛋白表达呈明显负相关(P<0.05)。结论 RKIP基因启动子的异常甲基化是引起蛋白表达缺失的原因之一,RKIP蛋白表达缺失与胃癌的发生、发展有关。李冬霞,张慧,汤正,武辉,李巧香 - 临床与实验病理学杂志文章来源： 万方数据 -
重甲基 SILAC 技术分析雄激素依赖性和非依赖性前列腺癌细胞组蛋白 H3甲基化的差异
目的:整体分析雄激素依赖性和非依赖性前列腺癌细胞组蛋白H3甲基化差异,探讨前列腺癌从激素依赖性发展为非激素依赖性的表观遗传机制。方法:应用重甲基细胞培养条件下氨基酸稳定同位素标记( SILAC)技术结合生物质谱分析雄激素依赖性前列腺癌细胞LNCaP和非依赖性前列腺癌细胞DU145组蛋白H3的甲基化修饰谱,寻找差异的修饰位点和模式;通过Western blotting验证所发现的差异修饰;采用real-time PCR检测2株细胞相关甲基化酶和去甲基化酶的表达差异。结果:质谱鉴定发现2株前列腺癌细胞的组蛋白H3存在5个甲基化位点,甲基化模式分别为 H3K14me2、H3R17me1、H3K36me1、H3K36me2、H3K36me3、H3R72me2、H3K79me1和H3K79me2。其中,包含甲基化位点H3K36的肽段有2种,分别为“KSAPATGGVKKPHR”和“KSAPST-GGVKKPHR”,前者鉴定到的频数高于后者,两者的区别在于第31位的氨基酸分别为A与S,前者归属于组蛋白H3变异体H31T、H31和H32,主要出现在DU145细胞中,后者归属于组蛋白H3变异体H33,在LNCaP细胞中出现次数稍多;提示2株细胞可能表达不同的组蛋白H3变异体,从而导致甲基化模式的差异。 Western blotting检测发现H3K36的一甲基化和二甲基化在2株细胞间没有差异,而其在DU145细胞中的三甲基化程度显著高于LNCaP细胞。 Real-time PCR检测显示DU145细胞的H3K36去甲基化酶mRNA表达比LNCaP细胞有所降低。结论:组蛋白H3变异体和H3K36去甲基化酶的差异表达可能导致非激素依赖性前列腺癌细胞H3K36三甲基化增加,成为前列腺癌从激素依赖性发展为非激素依赖性的一种表观遗传转变。王启林,李瑞乾,金从国,赵斌,张国颖,白宇,雷永虹 - 中国病理生理杂志文章来源： 万方数据 -
星形细胞瘤中MGMT甲基化与IDH1突变的相关性
目的 检测星形细胞瘤中DNA修复酶O-6-甲基鸟嘌呤-DNA-甲基转移酶(O6-methylguanine-DNA-methyltransferase,MGMT)的甲基化状态,分析其与IDH1突变的关系并评估二者对患者预后的影响.方法 采用甲基化特异性PCR(MSP)法检测176例星形细胞瘤中MGMT的甲基化状态;采用直接测序法和免疫组化法检测IDH1突变,并应用Log-rank检验比较不同分子标记对患者生存曲线的影响.结果 138例星形细胞瘤进行MGMT基因甲基化检测,72.46% (100/138)病例检测结果有效,57%肿瘤发生MGMT高甲基化.Ⅱ、Ⅲ级星形细胞瘤与继发性胶质母细胞瘤(glioblastoma,GBM)中MGMT的甲基化率显著高于原发性GBM(P=0.023 2).伴有IDH1突变的星形细胞瘤中MGMT的高甲基化率(29/37)显著高于无IDH1基因突变(28/63)病例(P=0.000 9).MGMT甲基化结合IDH1突变是患者预后较好的分子标记(P=0.000 0).结论 星形细胞瘤中MGMT的高甲基化状态与IDH1突变呈明显正相关;IDH1突变结合MGMT甲基化状态检测能更好地预测胶质瘤患者的预后.邵立伟,李永笑,潘怡,齐雪岭,钟延丰,常青 - 临床与实验病理学杂志文章来源： 万方数据 -
原发性肝癌RUNX3基因启动子区甲基化及其意义
目的 检测原发性肝癌( hepatocellular carcinomas,HCC)中人RUNT相关转录因子3(human runt-related transcription factor 3,RUNX3)基因启动子的甲基化情况,探讨其与患者临床特征的关系.方法 收集95例HCC患者的肿瘤标本及相应的癌旁肝组织、20例正常肝组织,95例HCC患者中合并肝硬化患者57例,按照肝硬化Child-Pugh肝功能分级标准,将57例患者分为A级36例,B级11例,C级10例,运用甲基化特异性PCR检测RUNX3基因启动子CpG岛甲基化状态,分析RUNX3甲基化情况与患者临床特征的关系.结果 95例HCC组织中,45.3% (43/95)存在RUNX3基因CpG岛的异常甲基化,癌旁肝组织中有9.5%(9/95)存在异常甲基化,而正常肝组织中未检测到RUNX3基因CpG岛的异常甲基化;RUNX3基因异常甲基化在HCC组织中的发生率与癌旁组织及正常肝组织比较差异有统计学意义(P<0.01),RUNX3基因CpG岛甲基化与患者肝硬化、门脉癌栓关系密切(P<0.05).肝硬化Child-Pugh肝功能C级组RUNX3启动子甲基化水平明显高于A级组和B级组(P<0.05).结论 HCC存在RUNX3基因CpG岛异常甲基化,CpG岛的甲基化可能是导致其基因表达降低的主要原因之一,并与患者肝硬化、门脉癌栓密切相关.李建国,江小杰 - 第三军医大学学报文章来源： 万方数据 -
N~6-甲基腺苷依赖的信使RNA稳定性调节
N6-甲基腺苷(N6-methyladenosine,m6A)修饰是现今最常见的高等真核生物信使RNA(mRNA)内部(非帽子结构)修饰,是在转录后由m6A甲基转移酶(如MT-A70)在序列的G(m6A)C(70%)或A(m6A)C(30%)部位上加工形成的.这种修饰对于细胞的存活和发育是必不可少的,但其确切作用仍有待进一步研究.最近,Wang等在哺乳类动物细胞发现2个m6A脱甲基酶FTO和ALKBH5,突出显示了m6A在基本生物学功能与疾病中的重要性-mRNA的甲基化是可逆的,从而能动态操控陈桂玲 - 中国病理生理杂志文章来源： 万方数据 -
结直肠腺癌患者外周血CNRIP1基因启动子甲基化的临床病理学分析
目的分析结直肠腺癌患者外周血大麻素受体互作蛋白1(cannabinoid receptor interacting protein 1,CNRIP1)基因启动子甲基化程度与临床病理学参数的相关性,探讨外周血CNRIP1基因启动子甲基化检测在结直肠腺癌早期筛查及病程评估中的价值.方法采用定量甲基化特异性PCR技术(quantitative methylation-specific PCR,qMSP)检测结直肠腺癌患者(50例)、结直肠腺瘤患者(20例)、健康志愿者(20例)外周血CNRIP1基因启动子CpG岛甲基化程度,并通过焦磷酸测序技术确定该基因启动子甲基化位点.登记结直肠腺癌患者临床病理参数.采用Fisher检验分析CNRIP1基因启动子CpG岛甲基化与结直肠腺癌临床病理参数的相关性.结果结直肠腺癌、结直肠腺瘤患者及健康志愿者外周血CNRIP1基因启动子CpG岛的2246位点甲基化程度分别为(85.50±8.24)%、(81.33±5.81)%、(63.66%±3.61)%(P<0.01);结直肠腺癌CNRIP基因启动子CpG岛2246位点甲基化程度分别与肿瘤直径、原发灶浸润深度、TNM分期具有显著相关性(P<0.01),与腺癌分化程度、淋巴结转移具有一定相关性(P<0.05).结论 CNRIP1基因启动子CpG岛2246位点甲基化程度与结直肠腺癌病程进展相对一致,可作为结直肠腺癌早期筛查及病程评估的标志物.张婷,崔戈,冯文明,姚韵靓,朱国良,石麒麟 - 临床与实验病理学杂志文章来源： 万方数据
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