-
FISH和RT-PCR法在ALK基因检测中的临床应用分析
目的:探讨荧光原位杂交( fluorescence in situ hybrid-ization, FISH)和实时荧光定量逆转录聚合酶链反应( real-time quantitative reverse transcriptase-polymerase chain reac-tion, RT-PCR)技术检测非小细胞肺癌中间变性淋巴瘤激酶(anaplastic lymphoma kinase, ALK)突变的差异性。方法应用FISH及RT-PCR技术分别检测22例非小细胞肺癌中ALK基因突变,采用Spearman Correlation统计法进行差异性比较分析。结果两种方法在检测非小细胞肺癌中ALK基因突变的结果具有一致性( P<0.05)。结论虽然两种方法检测ALK基因突变结果具有一致性,但实际操作中RT-PCR法比FISH法更简便、敏感、易判读。李霄,刘冲,李扬,朱芸,宋国新,张智弘 - 临床与实验病理学杂志文章来源： 万方数据 -
ALK基因FISH检测失败的补救方法
随着分子病理学和个体化靶向治疗的发展,FISH技术作为分子诊断的主要工具,应用越来越广泛和普及.FISH技术由于其具有检测ALK变异体类型的全面性,经FDA批准,用于临床非小细胞肺癌靶向用药人群的筛选.肺穿刺石蜡组织标本经过几轮切片(常规HE、免疫组化、EGFR突变检测),所剩组织只能切出为数不多的适合FISH(切片可计数细胞>50个)实验的切片,如果FISH实验失败,几乎不可能重新切片;外院会诊的病例也存在无法重新获得白片的情况.因此,作者直接将FISH实验失败的片子重新处理,加探针,得到比较满意的结果,现介绍如下.许洁,陈洁,张科平,骆新兰,朱小兰,庄恒国,刘艳辉 - 临床与实验病理学杂志文章来源： 万方数据 -
mTOR 信号通路在克唑替尼诱导的 EML4-ALK融合基因阳性肺癌细胞株 H2228凋亡中的作用
目的:探讨以磷脂酰肌醇3-激酶相关激酶蛋白家族成员哺乳动物雷帕霉素靶蛋白( mTOR)为中心的信号通路在克唑替尼( crizotinib)诱导的棘皮动物微管结合蛋白样蛋白4-间变性淋巴瘤激酶( EML4-ALK)融合基因阳性的非小细胞肺癌细胞株H2228凋亡中的作用。方法:根据不同的实验目的处理H2228细胞后,荧光定量PCR检测基因状态,MTT法检测细胞抑制率;流式细胞术检测细胞凋亡和细胞周期;Western blotting 检测细胞mTOR信号通路中关键蛋白的表达及活化水平。结果: Crizotinib对H2228细胞有促凋亡作用,呈时间和剂量依赖性,且能使H2228细胞阻滞在G1期。在使用crizotinib处理的凋亡细胞株中发现mTOR活化水平降低,mTOR上、下游关键蛋白的活化水平都呈下降趋势,肺癌细胞株H2228中特殊表达的融合蛋白EML4-ALK变异体3表达量未受影响,但其活化形式p-ALK明显受到抑制。结论:初步证实mTOR信号通路在crizotinib诱导含有EML4-ALK融合基因的肺癌细胞H2228凋亡中有一定作用,为crizotinib的作用机制提供了依据。- 中国病理生理杂志文章来源： 万方数据 -
伴有ALK基因融合的Spitz痣、非典型Spitz肿瘤的临床病理学特征
Spitz肿瘤是一组发生于青年人,主要由梭形及上皮样肿瘤细胞组成的黑色素细胞肿瘤.Spitz黑色素肿瘤包括良性的Spitz痣,恶性潜能未定的非典型Spitz肿瘤和Spitz样恶性黑色素瘤.目前通过皮肤病理学形态上鉴别惰性病变或是侵袭性致命肿瘤仍是一个难题.有研究表明,Spitz肿瘤存在包括ALK基因融合在内的多种基因融合,且这些基因融合肿瘤具有特定的临床病理特点.为此作者对17例伴有Busam K L,Kutzner H,Cerroni L,陈佳菁,余英豪 - 临床与实验病理学杂志文章来源： 万方数据 -
脑转移性ALK阳性间变性大细胞淋巴瘤1例
患者男性,49岁.10年前发现腹膜后肿物,可活动、有轻度压痛.在外院行手术切除,病理诊断为腹膜后间变性大细胞淋巴瘤(anaplasticlargecelllymphoma,ALCL),术后行放、化疗,复查未见复发.本次因头痛及右侧肢体乏力1个月余入院,平素常出现恶心呕吐,右下肢感觉异常,跛行.MRI检查示左顶叶类圆形占位,周围脑组织明显水肿.术中见肿块位于硬膜下,左侧顶叶中央后皮层下脑内,顶部矢状窦旁脑王彩霞,王建军,余波,李杰,马恒辉,陆珍凤,石群立 - 临床与实验病理学杂志文章来源： 万方数据 -
人类mtDNA D-Loop区位点变异对基因表达的影响
Case-Control研究表明,人线粒体基因(mtDNA) D-Loop区mt235、mt514-515、mt16183、mt16290和mt16319多态位点与有氧运动能力有关.拟从下游基因表达做进一步的研究,以探讨上述多态位点的分子调控机理.方法:采用全基因组合成法合成包含上述多态位点的DNA序列,分别连接到pGL3-promoter载体构建重组质粒,将重组质粒转染至293T细胞,观察携带5对mtDNA质粒对下游双荧光素酶报告基因的表达及荧光素酶mR-NA表达的影响.结果:携带mt235A、mt514-515CA、mt16183A和mt16319G的载体转染细胞的双荧光素酶基因表达量显著高于mt235G、mt514-515Del、mt16183C和mt16319A(P<0.01);携带mt16290两种基因型的质粒转染细胞报告基因表达没有明显差异.与pGL3-promoter载体相比,携带mt16319A的质粒转染细胞荧光素酶mRNA极显著下降(P<0.01),携带mt16290位点的两种质粒对报告基因mRNA的影响没有差异.结论:mt235、mt514-515、mt16183和mt16319多态位点影响荧光素酶基因表达,mt235A、mt514-515CA和mt16183A上调基因转录和翻译,mt16319A下调基因转录.这些基因表达上的差异可能是影响人有氧运动能力的重要调控因素.龚丽景,胡扬,李燕春,梅涛 - 体育科学文章来源： 万方数据 -
免疫组化染色及FISH法检测肺鳞状细胞癌中ALK蛋白的表达
目的:探讨棘皮类微管蛋白4(echinoderm microtubule-associated protein-like 4, EML4)与间变性淋巴瘤激酶基因(ana-plastic lymphoma kinase, ALK)融合在肺鳞状细胞癌中的发生率,为进一步开展靶向治疗提供参考。方法采用高度特异性和敏感性的ALK抗体(D5F3)对219例肺鳞状细胞癌石蜡包埋组织标本进行免疫组化染色,并对阳性标本行EML4-ALK荧光原位杂交技术(fluorescence in situ hybridization, FISH)检测。结果免疫组化染色检出ALK强阳性标本4例(1.8%,4/219)、中等强度3例和弱阳性6例。 FISH检测确认ALK强阳性标本存在EML4-ALK基因融合,中等和弱阳性标本为假阳性。结论肺鳞状细胞癌中存在少量EML4-ALK基因融合,其是否对Crizotinib治疗敏感亟需进行临床研究;免疫组化检测ALK蛋白强阳性才能判断为EML4-ALK基因融合。王建东,余波,孙绪,王璇,王海,马捷,周晓军,石群立 - 临床与实验病理学杂志文章来源： 万方数据 -
地域文化基因再现及人本观转基因空间控制理念
文化景观是环境层面上文化行为的空间产物,地域文化景观反映该地域文化体系的地理单元特征.地域文化遗产性景观揭示传统文化(尤其是心理期盼认知传统行为)在空间上传承与形制叠加的人文地理性.对后者的研究国外已借用生物传承多样性的"基因、物种和生态系统"理念去解构.诸多研究多涉及聚落景观及其基因方面,还没有全方位延伸到地域文化景观的各类型,尤其很少介入地域传统文化(风水观)遗产性基因,及其遗产景观基因的排列或组合或结构的研究.本文引用人文地理学"社会-文化"转向创立的"现象学结构主义"方法,首次系统揭示(中国)地域文化遗产(形制)基因与结构;并据后现代人本性空间观理念,即在满足遗产性景观所在地(或社区)生活空间质量需求规律下,论及提升文化产业展现内涵下的遗产景观基因再现控制理念.王兴中,李胜超,李亮,郭祎,刘娇 - 人文地理文章来源： 万方数据 -
IPO8基因启动子区rs35100176位点变异对基因表达的影响
目的:研究人importin 8( IPO8)基因启动子区rs35100176多态性位点CCT插入/缺失对基因表达的影响。方法:PCR扩增IPO8基因启动子区包含rs35100176多态位点的342 bp序列,通过测序获得了49例DNA样本的基因多态性分布。以CCT/CCT插入纯合子或-/-缺失纯合子DNA样本为模板,扩增含有不同插入/缺失序列的IPO8基因启动子片段,插入萤光素酶报告质粒pGL3-Basic,构建pGL3-3N Insertion和pGL3-3N Deletion重组表达载体。重组质粒经Fugene 6.0转染入细胞,采用双萤光素酶报告系统,检测携带不同多态性序列的重组质粒中报告基因的表达活性;real-time PCR 检测各不同基因型细胞中 IPO8 mRNA 表达。结果:通过测序发现rs35100176多态位点存在 CCT/CCT、CCT/-和-/-3种表型,其基因分布频率分别为18.37%、55.10%和26.53%。成功构建pGL3-3N Insertion和pGL3-3N Deletion重组表达载体。双萤光素酶报告基因活性检测结果显示,pGL3-3N Insertion启动下游报告基因表达的相对活性与pGL3-3N Deletion 相比显著减弱,两者存在显著差异(P<0.05);real-time PCR结果显示,CCT纯合插入的HEK293细胞中IPO8 mRNA的表达显著低于CCT纯合缺失的Saos-2细胞。结论:IPO8基因启动子区rs35100176位点的CCT碱基插入变异能显著抑制启动子活性,从而影响IPO8基因的转录。熊建军,江和,许晓源,周小鸥,王庭,李卫东 - 中国病理生理杂志文章来源： 万方数据 -
原发性肺印戒细胞癌6例临床病理分析
目的 探讨原发性肺印戒细胞癌(signet-ring cell carcinoma,SRCC)的临床病理特征及生物学特征.方法 回顾性分析6例肺SRCC的临床病理资料,采用FISH技术检测其中2例肿瘤组织EML4-ALK基因融合情况,并复习相关文献.结果 镜下见瘤细胞胞质内富含黏液,胞核偏于一侧呈印戒状.免疫表型:瘤细胞弥漫性表达TTF1和CK7,2例局部表达p63.2例瘤组织EML4-ALK融合基因阳性.患者容易发生淋巴结和远处转移.结论 原发性肺SRCC有特异性组织学特点、免疫表型和基因改变,提示其可能为腺癌的一种亚型,与其他腺癌相比预后差.李桂梅,杨志慧,梅佳,曹晓卉 - 临床与实验病理学杂志文章来源： 万方数据
科创中国
