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基于形态及分子性状对介形类高级分类体系的分析
运用最大简约法(MP)对介形纲中9个主要类群的27个形态性状及18S rDNA序列进行分析,并构建系统发育一致树,以期为尚存争议的现生介形类高级阶元分类提供新的证据.结果显示punciidaen自成一类,其分类地位与尾肢亚纲(Podocopa)和壮肢亚纲(Myodocopa)相当,可命名为"Punciocopa",但仍需更多的证据加以证实;而吸海萤类(halocypridian)由于基于形态与分子证据获得的拓扑结构不一致,其分类地位尚无法得以解决;在介形类3个亚纲中,尾肢亚纲应包括金星介(Cypridocopina)、浪花介(Cytherocopina)、巴氏介(Bairdiocopina)、达尔文介(Darwinulocopina)和泡沫介(Cytherellidae)5个类群,壮肢亚纲至少包括分肢介(Cladocopida)和壮肢介(Myodocopida)两个类群,而"Punciocopa"仅有Punciidae科.禹娜,李二超,陈立侨 - 华东师范大学学报(自然科学版)文章来源： 万方数据 -
北京市房山区羊梨形虫病流行病学调查
为了解北京郊区羊梨形虫病的流行情况,本研究采用形态学检测,同时结合使用梨形虫18S rRNA基因通用引物进行PCR与直接测序法,对来自北京市房山郊区某养殖场的120只山羊及15只绵羊全血样本进行检测.结果发现血涂片中梨形虫检测阳性率为95.0%,其中吕氏泰勒虫Theileria luwenshuni于山羊中检出115例阳性,阳性率95.8%;于绵羊中检出6只阳性;未发现其他泰勒虫以及巴贝斯虫的感染.本研究首次对北京周边地区进行羊梨形虫分子流行病学研究,发现房山地区为吕氏泰勒虫流行区,并且发现山羊对吕氏泰勒虫可呈现长期带虫感染.向金波,邱正良 - 寄生虫与医学昆虫学报文章来源： 万方数据 -
黑龙江大豆轮作和连作土壤细菌群落多样性比较
为研究大豆轮作和连作对土壤细菌群落多样性的影响,提取黑龙江大豆轮作和连作土壤微生物总DNA,采用细菌通用引物27F和1492R扩增了土壤细菌16S rDNA片段,构建了细菌16S rDNA克隆文库,并对文库中的细菌群落多样性进行了分析.通过16S rDNA序列同源性分析,发现76.5%克隆序列与环境中未培养细菌的16S rDNA序列有较高的相似性,仅有23.5%的克隆序列与GenBank数据库中可培养细菌有较高的相似性,表明黑龙江大豆田土壤中的多数细菌尚未培养.系统发育分析表明黑龙江土壤细菌分属于6大类群,其中变形菌Proteobacteria和酸杆菌Acidobacteria所占比例较大,另有少量厚壁菌Firmicutes、放线菌Actinobacteria、芽单胞菌Gemmatimonadetes和未分类的细菌.大豆轮作土壤细菌多样性更为丰富,并以变形菌为优势细菌类群;而大豆连作土壤细菌多样性有所减少,以酸杆菌为优势细菌类群.表明黑龙江大豆田土壤中细菌多样性十分丰富,其种植方式对土壤细菌群落结构影响较大.朱英波,史凤玉,张瑞敬,武云鹏 - 植物保护学报文章来源： 万方数据 -
一株产纤维素酶细菌的分离鉴定及其酶学特性研究
采用CMC平板筛选和刚果红染色等方法,从湖南科技大学校园腐烂木芙蓉根部土壤中分离1株产纤维素酶菌株CXB001,经生理生化测试、16SrDNA分子进化树分析,鉴定菌株为Bacillus velezensis.对该菌株的生物特性研究表明,其最适生长温度为37℃,在10~ 50 ℃,pH5.0 ~11.0中能生长,在pH 6.0~9.0,34~40℃,1.5% ~3.5% NaC1的培养条件下,最适产酶.CXB001所产纤维素酶最适反应温度为50℃,最适反应pH为5.0;在20℃、pH 5.0~7.0具有较好的稳定性.Co2+对纤维素酶具有激活作用,Mg2+,Fe2+对纤维素酶具有抑制作用.邓先余,邹谋勇,黄志坚,易俗 - 中山大学学报(自然科学版)文章来源： 万方数据 -
16S rDNA测序在呼吸机相关性肺炎痰液细菌多样性分析中的应用
目的 用16S rDNA测序研究呼吸机相关性肺炎(VAP)患者痰液中致病菌的种类和丰度,探讨VAP病原学诊断的新方法.方法 对31例VAP患者进行支气管肺泡灌洗,提取痰液标本细菌DNA,进行聚合酶链反应(PCR)鉴定,同时进行痰液细菌培养.利用16S rDNA测序技术进行宏基因测序及生物信息学分析,并将测序结果与细菌培养结果比较.结果 ①31例VAP患者中27例患者的痰液标本550 bp处扩增出特异的DNA产物用于测序分析.16S rDNA测序共得到103 856条序列,39 Mb的原始数据.Tag物种注释27份样本均可注释到属的水平.②样本复杂度分析:Alpha多样性分析显示27份样本Shannon指数约为1.20,Simpson指数约为0.48,表明VAP痰液样本中细菌物种丰富且较为复杂.稀释曲线趋势分析提示部分VAP痰液样本还存在较多未被测序检测到的物种.③样本多样品分析:VAP痰液样本16S rDNA测序分析共出现放线菌门、拟杆菌门、硬壁菌门和变形菌门4个细菌门.以属为分类标准,优势菌属为链球菌属88.9%(24/27),变性菌属77.8%(21/27),不动杆菌属70.4%(19/27),鞘氨醇单胞菌属63.0%(17/27),普氏菌属63.0%(17/27),克雷伯菌属55.6%(15/27),假单胞菌属55.6%(15/27),水杆菌属55.6%(15/27),棒状杆菌属55.6%(15/27).④16S rDNA测序法与细菌培养结果比较:测序法检测可发现普通细菌培养未检测到的普氏菌属、变性菌属、水杆菌属、鞘氨醇单胞菌属;两种方法共同检测到的7种菌属中,测序法检测到的链球菌属[88.9%(24/27)]、克雷伯菌属[55.6%(15/27)]、不动杆菌属[70.4%(19/27)]、棒状杆菌属[55.6%(15/27)]的阳性率均高于普通细菌培养[分别为18.5%(5/27)、18.5%(5/27)、37.0%(10/27)、7.4%(2/27),P<0.05或P<0.01],假单胞菌属阳性率较普通细菌培养法有增高趋势[55.6%(15/27)比25.9%(7/27),P=0.050];而测序法与细菌培养检测到葡萄球菌属[7.4%(2/27)比11.1%(3/27)]、奈瑟菌属[18.5%(5/27)比3.7%(1/27)]的阳性率则均无差异(均P>0.05).结论 16S rDNA测序分析证实VAP患者的痰液致病菌菌种复杂多样,物种丰富,多种多重耐药菌株定植.与普通细菌培养比较,16S rDNA宏基因组测序发现病原体阳性率更高.16S rDNA基因测序技术可能成为VAP病原学诊断的新方法.杨晓军,王晓红,梁志娟,张小亚,王妍柏,王振海 - 中华危重病急救医学文章来源： 万方数据 -
慢性根尖周炎瘘管发生与根管内特殊细菌定植相关性的初步研究
目的:检测和比较有瘘型与无瘘型根尖周病感染根管内优势菌丛的分布特点.方法:选择60位慢性根尖周炎患者共64颗患牙,在对每个患牙进行根管治疗的过程中,髓腔预备及根管初预备后,用无菌纸尖吸取根管内容物进行采样,置入无菌EP管,于10 min内送至-20℃冰箱保存.对根管内样本进行genomic DNA提取,使用27种选取的由基因公司提供的感染根管内优势菌的引物对上述64例样本进行多重模板扩增,根据扩增产物的有无判断各样本中含有的菌种类型.结果:瘘管的发生与Prevotella nigrescens(变黑普氏菌)、Porphyromonas spp.(卟啉单胞菌)、Peptostreptococcus stomatis(口炎消化链球菌)、革兰氏阴性球菌、Capnocytophaga ochracea(黄褐二氧化碳嗜纤维菌)、Corynebacterium matruchotii(马氏棒杆菌)、Hafnia spp.(哈夫尼菌属)及Eubacterium spp.(真杆菌属)的感染有关.结论:慢性根尖周炎瘘管发生与根管内分离到的Prevotella nigrescens、Porphyromonas spp.、Peptostreptococcus stomatis、革兰氏阴性球菌、Capnocytophaga ochracea、Corynebacterium matruchotii、Hafnia spp.及Eubacterium spp.的特异性定植有关.李欣,王霄,张成飞 - 口腔医学研究文章来源： 万方数据 -
承德市水化学特征分析
为了了解和掌握承德市水化学特征,采用统计学分析方法、阿廖金分类法和舒卡列夫分类法对承德市地表水、浅层地下水水化学特征进行了分析.结果表明,承德市地表水中的矿化度、总硬度、Ca^2+、HCO3^-和浅层地下水中的HC03一这些指标的变异系数小于30%,离散程度小,含量比较稳定,地表水中HCO3^-和浅层地下水中的Cl^-、SO4^2-、CO3^2-这些指标变异系数大于90%,离散程度大,稳定性较差;地表水的总硬度及矿化度随地理分布存在定的规律,从西北到南部,总硬度和矿化度的值由低到高分布;承德市地表水和浅层地下水的主要阴阳离子构成基本一致,阳离子以Ca^2+、Mg2+为主,阴离子以HC03一为主.分析原因,沿河打井取水,是承德山区取用浅层地下水的主要方式,地表水是浅层地下水的主要补给来源,两者之间没有一个明显的界限.高玉鼎,陆永新,张东莱 - 南水北调与水利科技文章来源： 万方数据 -
无机氮肥不同基追比对新稻18产量和品质的影响
为了探讨水稻新品种新稻18适宜的基肥与追肥比例,通过对新稻18氮肥不同基追处理3年的试验研究,结果表明,该品种作为水稻中熟中粳高产水稻的代表,氮肥基肥与追肥在4∶6和3∶7时穗数分别达到3.45*106/hm2和3.48*106/hm2,穗粒数分别达到158.7,158.6粒,千粒质量达到27.9,27.2g,与其他4个处理相比差异显著,产量优势明显;同时氮肥基肥与追肥在3∶7的比例下整精米率较高,垩白度和直链淀粉含量均较低,胶稠度较长,表现出较好的碾米品质和外观品质.因此,在氮肥基追比为3∶7时,理论产量为9 584.7 kg/hm2,综合品质最优,是较为合理的一种氮肥基追模式.张翠翠,常介田,高素玲,杨青华 - 华北农学报文章来源： 万方数据 -
基于射频技术的无线环境监测系统设计与实现
随着射频技术的日益成熟,文中提出了一种无线的环境监测系统.本系统分为1个主机和2个从机,从机利用传感器采集现场房间温度、湿度和空气污染程度等环境参数,利用LCD12864实时显示,并通过nRF905无线通信模块发送采集的环境参数.在主控室主机和计算机终端串口相连,在计算机上通过监测软件实时显示各个房间的各种环境参数,并且还具有报警功能.该系统性能稳定,抗干扰能力强,搭建方便,在现实生活中有很强的实用性.刘燎原,袁德明 - 电子设计工程文章来源： 万方数据 -
rDNA-ITS2序列作为中国按蚊分子鉴别特征的评述:Ⅱ塞蚊亚属
为评价核糖体DNA第2内转录间隔区( rDNA-ITS2)序列作为中国按蚊属塞蚊亚属蚊种鉴别的分子特征。笔者整理和分析了数据库中注册的所有中国记录的塞蚊亚属蚊种的rDNA-ITS2序列,并应用MEGA软件计算其在种内和种间的差异性( p距离)。截止2013年7月, GenBank中已注册ITS2序列共442条,隶属塞蚊亚属蚊27种。计算结果显示, ITS2序列在大多数种内的变异性小于1%;而注册的浅色按蚊、乌头按蚊和溪流按蚊的序列种内差异较大,无法确定其种特异序列;忽略上述3蚊种进行计算的其他种间序列差异性范围为2.80%(大劣按蚊与大劣按蚊D)~68.3%(多斑按蚊与迷走按蚊)。结果提示rDNA-ITS2序列在中国塞蚊亚属大多数蚊种中具有良好的种内保守性和种间解析度,少数种类无法区分。伍桐,诸德源,王一然,马雅军 - 寄生虫与医学昆虫学报文章来源： 万方数据
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