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基于SNPs标记的部分栽培稻品种遗传结构分析
利用分布于水稻12条染色体上的190个SNPs位点,对97个水稻品种进行了遗传多样性和遗传结构分析.结果表明,190个SNPs位点中有92个具有多态性,多态性比率为48.42%.品种间的遗传相似系数(GS)变化范围在0.34 ~1.00之间,平均GS为0.87.贝叶斯聚类和UPGMA法聚类的结果相似,均将供试材料分成籼、粳2个亚种,且品种间的亲缘关系与地理来源关系不大.通过SNPs标记的遗传多样性分析结果表明,供试材料在亚种内的亲缘关系较近、遗传基础狭窄,部分供试品种具有相似的遗传背景.高月,姜树坤,钟鸣,马慧,郭志富,陈丽静,李浩戈,徐正进 - 华北农学报文章来源: 万方数据 -
牦牛脂肪型脂肪酸结合蛋白基因(A-FABP)多态性分析
脂肪型脂肪酸结合蛋白(A-FABP)属脂肪酸结合蛋白家族(FABPs)成员,参与调节哺乳动物细胞内脂肪浓度,进而影响肌肉内脂肪含量(IMF),因此A-FABP可作为影响IMF的候选基因.本研究采用PCR-SSCP技术检测甘南牦牛、青海牦牛、天祝白牦牛(Bos grunniens)A-FABP基因部分第3内含子、第4外显子及部分3'-UTR区单核苷酸多态性( SNPs),分析检测区域分子遗传特征.结果表明,3类群牦牛引物扩增区域发现5种等位基因A-E;同普通牛A-FABP基因序列比对发现6处SNPs,其中第4外显子区存在c.4222A>G的同义突变;3'-UTR区c.* 94T>A只存在于牦牛群体,是其区别于普通牛的遗传特征之一.各等位基因在群体间分布差异较大,其中天祝白牦牛只发现3种等位基因,而青海牦牛发现4种等位基因,这可能与牦牛类群的地域分布及选育程度有关.3类群牦牛A-FABP基因检测位点表现为中度多态(PIC为0.29 ~0.36),有效等位基因数较高,可作为潜在的牦牛肉质性状分子标记位点.曹健,罗玉柱,胡江,成述儒,杨果,刘秀 - 华北农学报文章来源: 万方数据 -
74046例阿尔茨海默病确认11个新的易感基因位点的Meta分析
以往的文献报道确定了迟发性阿尔茨海默病(LOAD)的11个易感基因位点;然而,这种疾病大部分的遗传风险仍无法解释.本研究对欧洲人的全基因组关联研究(GWAS)进行了广泛、两个阶段的Meta分析.在第一(筛选)阶段,本研究使用基因分型和估算(包括7 055 881个SNPs数据),对以前发表的4个GWAS数据集进行Meta分析,包括17008例阿尔茨海默病病例和37 154例对照.在第二(验证)阶段,对8 572例阿尔茨海默病病例和11 312例对照的11632个SNPs进行基因分型和测试.结合初筛阶段和验证阶段的综合分析,除APOE基因(编码载脂蛋白E)之外,有19韩鸿雁,许春伟(摘译),李晓兵(审校) - 临床与实验病理学杂志文章来源: 万方数据 -
采用新一代测序技术分析头颈部鳞状细胞癌的分子异质性
依据与高危亚型人类乳头状瘤病毒(HPV16、18)的相关性,头颈部鳞状细胞癌(HNSCC)被分为两种不同的临床亚型组.近年来,在某种程度上由于与HPV感染有关的HNSCC在逐渐增加,且其在预后和分子组织学方面的差异引起学者们的注意,然而,如何分类这些肿瘤,其潜在的作用机制和详尽的基因组织学仍然未被阐明.为了阐明伴和不伴HPV感染的HNSCC致癌途径,我们采用定向的新一代测魏建国(摘译),许春伟(审校),Baisre A - 临床与实验病理学杂志文章来源: 万方数据

