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基于数据分析探索APL中内含子microRNA与PML-RARα组成的调控环路

原文链接：万方

• 作者：

  涂序辉,王侃侃,张济

• 摘要：

  目的:探索急性早幼粒细胞白血病(acute promyelocytic leukemia,APL)中microRNA、PML-RAR α与下游靶基因组成的调控模式.方法:应用基于染色质的免疫沉淀( chromatin immunoprecipitation on chip,ChIP-on-chip)技术并结合数据分析方法对miRNA和PML- RARα与下游靶基因形成的调控环路进行研究.结果:在PML-RARα所调节的基因中,相当一部分同时也在转录后被PML-RARα潜在调节的miRNAs所调节,从而组成特定的调控环路.对于不同的内含子miRNAs,类型Ⅰ的调控环路模式在白血病细胞分化过程中更为普遍存在.结论:APL中microRNA与PML-RARα通过特定的调控环路调控下游靶基因的表达.

• 关键词：

  CHIP-on-chip miRNA 调控网络

• 作者单位：

  上海交通大学医学院附属瑞金医院%上海市血液学研究所医学基因组学国家重点实验室

• 基金项目：

  国家自然科学基金(30730033)% 上海科技委员会资助项目(07SP07002)~~

• 来源期刊：

  海南医学院学报

• 年，卷(期)：

  2012009