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利用染色质免疫共沉淀测序研究Twist1结合的靶DNA序列

原文链接：万方

• 作者：

  孙涛,孙保存,赵秀兰,赵楠,古强,董学易,车娜,池嘉栋

• 摘要：

  目的:利用染色质免疫共沉淀测序研究Twist1结合的靶DNA序列,比较过表达Bcl-2和正常状态下Twist1结合靶DNA序列的变化.方法:筛选常态表达Twist1的肝癌细胞系,分别转染Bcl-2表达质粒和对照空载体,收集转染后细胞以甲醛交联DNA,收集样品进行染色质免疫共沉淀,获得与Twist1蛋白结合的DNA片段进行测序分析.结果:通过对5种肝癌细胞系进行筛选,观察到HepG2可表达Twist1,其与DNA结合序列在空载体对照组和Bcl-2过表达组具有很大的差别,结合DNA数量分别为68条和212条,其中共享序列154条.结论:Twist1在不同环境下与DNA结合位点多达212个,涉及粘附分子、细胞骨架、信号转导、代谢和转录调节等多种生物学功能.

• 关键词：

  Twist1 染色质免疫共沉淀 靶DNA序列

• 作者单位：

  天津医科大学病理学教研室%天津医科大学附属肿瘤医院病理科

• 基金项目：

  国家自然科学基金重点资助项目(30830049)%国家自然科学基金面上资助项目(81172046)% 天津市科技支撑资助项目(中瑞合作,09ZCZDSF04400)

• 来源期刊：

  天津医科大学学报

• 年，卷(期)：

  2012003