-
猪圆环病毒2型河南株全基因组的克隆与序列分析
利用PCR方法,对河南郑州、南阳、焦作等地采集的疑似猪圆环病毒2型(PCV2)感染的病料进行检测.PCR检测为阳性的病料经处理后,接种无PCV污染的PK-15细胞中盲传6代,克隆11株PCV2全基因组并进行序列分析.结果表明,11株PCV2中有10株基因组全长为1 767bp,基因组分型为PCV2b,1株为1 768bp,说明PCV2b是河南省断奶后多系统衰竭综合征(PMWS)发生的主要因素;11个毒株的同源性位于94.9%~100%,与其他毒株的同源性为94.7%~100%;10株基因组为1 767bp的毒株处于一大分支上,遗传进化比较稳定;本试验为PCV2在河南地区的分子流行病学、遗传变异及防治奠定了基础.王亚丹,卢权威,陈红英,崔保安,王淑娟,朱前磊,王子馨,钞安军 - 中国兽医学报文章来源： 万方数据 -
多类别肿瘤基因表达谱的自动特征选择方法
从信息学角度出发寻找肿瘤相关基因、发现肿瘤基因表达特征对肿瘤的诊断和治疗具有重要的生物学意义,而肿瘤与正常组织的分类是其中一个重要应用.根据多类别肿瘤基因表达谱,提出了一种自动特征选择方法.首先,结合非参数方法和filter思想,利用决策序列的随机性度量基因的权值并排序;然后,采用相关信息熵进行冗余性排除,自动地选择出具有高分辨能力、低冗余度的特征基因子集.实验结果表明,提出的方法能从多类别肿瘤基因表达谱数据中自动选出30个具有良好分类能力的特征基因,且具有较高的正确识别率.高娟,王国胤,胡峰 - 计算机科学文章来源： 万方数据 -
千里光肌动蛋白基因(Actin)的生物信息学及功能分析
肌动蛋白(Actin)是广泛存在于高等植物中的组成型表达蛋白质,与细胞分裂、细胞运动、细胞信号转导等功能密切相关.为明确肌动蛋白性质与功能的关系,本研究从千里光全长cDNA文库中分离得到Actin基因.序列分析结果表明:该基因长度为1 481 bp,编码360个氨基酸残基的多肽,与甘草Actin基因编码的氨基酸序列(GenBank登录号:ABW71681.1)的同源性最高,达96%;预测蛋白质的分子量为40.02 kDa,理论等电点为5.85;结构分析发现,螺旋结构和无规则卷曲构成Actin二级结构的主要组分;三级结构预测发现,Actin具有4个结构域;蛋白系统发生树发现,与甘草和鹰嘴豆的亲缘关系较近.本研究认为,高等植物Actin可能参与基因的转录调控,其氨基酸突变位点未对功能结构域产生影响.张珍,平军娇,蔡振锋,汤贤春,钱刚 - 植物研究文章来源： 万方数据 -
比较表观基因组学方法来研究基因组调节功能
人类基因组测序产生了大量的基因信息,但是理解每个基因的功能的目标仍未实现.比较表观基因组学(comparative epigenomics)能进行DNA和组蛋白修饰的种间比较,对起调节作用的基因组序列进行标注,该方法能确定基因的作用.- 中国农业科技导报文章来源： 万方数据 -
美科学家发现不同植物种类存在相同基因序列
据2012年4月11日《科技日报》援引该报华盛顿4月9日电,美国密苏里大学研究人员与加州大学和亚利桑那大学库尔金等研究人员利用开创性的计算机算法发现,相同的DNA序列存在于多种植物基因组内完全不同的位置.该发现帮助解决了某些有关植物的进化之谜.- 生物学教学文章来源： 万方数据 -
食管鳞状细胞癌基因组改变的确认
食管癌是最具侵袭性的癌症之一,居全球恶性肿瘤病死率的第六位.全球约70%的食管癌患者在中国,食管鳞状细胞癌是最常见的病理类型(>90%).目前,临床上对于食管鳞状细胞癌的早期诊断和治疗非常有限,患者5年生存率仅为10%.然而,直到目前对于导致食管鳞状细胞癌发病的完整基因组事件仍知之甚少.本组对158例食管鳞状细胞癌病例进行一次全面的基因组分析:其中17例食管鳞状细胞癌病例进行全基因组测序,71例进行外显子测序,在崔淼,许春伟(摘译),张博(审校) - 临床与实验病理学杂志文章来源： 万方数据 -
猪源副黏病毒HX01株分离鉴定、全基因测序与遗传变异分析
从陕西省户县某猪场患流感样症状病死仔猪肺脏分离得到1株副黏病毒,命名为猪源副黏病毒(PPMV)HX01株,对分离毒株鉴定后进行部分生物学特性研究和全基因测序分析.参考PPMV JL-1株基因组序列设计10对引物,对PPMV HX01株分段扩增并测序,将测序成功的各序列依次拼接得到全基因序列并进行序列比对.该病毒MDT为91.2h,ICPI和IVPI为0,EID50为10-10.25/mL,表明该毒株属于新城疫弱毒株.序列分析结果表明,PPMV HX01株(全基因序列GenBank登录号:JF795531)与NDV参考毒株全基因核苷酸同源性83.3%~99.8%,该病毒与基因Ⅱ型我国传统弱毒疫苗株La Sota全基因水平和各个基因编码开放阅读框的同源性均在99.5%以上,而与基因Ⅸ型国家标准强毒株F48E9和目前流行的基因Ⅶ型毒株亲缘关系较远.陈胜利,刘辉,唐文雅,郝华芳,张渭东,王兴龙,杜恩岐,张淑霞,党如意,杨增岐 - 中国兽医学报文章来源： 万方数据 -
不同周期的P元m序列之间的互相关性质
基于Ness和Helleseth等人对二元不同周期的m序列之间的互相关函数的研究,研究了不同周期的p元m序列之间的互相关性质,给出了周期为p2 m-1和pm-1的m序列之间的互相关函数所满足的方程,同时证明了当p等于3时,互相关函数至少是3个值的.孙玉花,李晖,闫统江 - 西安电子科技大学学报文章来源： 万方数据 -
汉代墓地祠堂建筑考
汉代的家庭结构、服丧制度、升仙观念使汉代墓地祠堂不同于明清以后祠堂.根据现有资料,对汉代墓地祠堂中祠堂、冢舍、庖厨、阙、华表等组群要素、空间序列以及木构和石构祠堂的形制进行考述,以期形成对汉代墓地祠堂的基本认识.黄婧琳 - 建筑学报文章来源： 万方数据
科创中国
