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环介导等温扩增技术在快速检测炭疽芽胞杆菌中的应用
本文旨在建立适合国境口岸现场应用的生物恐怖防控快速检测方法,从而保障口岸安全.针对生物恐怖炭疽芽胞杆菌,选择目标菌种特异性基因片段,设计引物,运用环介导等温扩增(LAMP)技术建立一套简便、高效的检测方法,并模拟生物恐怖炭疽芽胞杆菌可能存在的基质条件,评价LAMP技术在快速筛查中的适用性.结果显示,LAMP技术排查生物恐怖炭疽芽胞杆菌简便、快速、特异,检测灵敏度为102~103 CFU/ml;且能有效检出在偏酸、偏碱及黏稠基质中的炭疽芽胞杆菌.而高盐环境对该反应影响较大,有必要采用能有效去除盐分的核酸抽提方法.段圣亮,陆晔,田桢干,王桂江 - 微生物与感染文章来源： 万方数据 -
FISH技术检测TERC基因在子宫颈上皮内瘤变1级与2级鉴别诊断中的实用价值
目的:采用FISH技术检测TERC基因在子宫颈上皮内瘤变( cervical intraepithelial neoplasia, CIN)不能明确1级或2级(CIN1/2)病变组织中的扩增,探讨其在CIN分级中的临床病理实用意义。方法选取子宫颈组织标本42例,其中正常子宫颈鳞状上皮20例,CIN1/2级22例(其中初步诊断1级8例,2级14例)。采用FISH技术检测石蜡包埋组织中TERC基因的扩增情况。结果正常子宫颈鳞状上皮中TERC基因无扩增,CIN1/2级组织中TERC基因的扩增率为22.7%(5/22),77.3%(17/22)的TERC基因无扩增;其中初步诊断1级8例,1例TERC基因扩增;初步诊断2级14例,4例TERC基因扩增,差异有统计学意义(P<0.05)。结论在石蜡包埋组织切片难以确定CIN1/2级时,应用FISH技术进行TERC基因检测,TERC基因扩增者可考虑为CIN2级,建议临床积极处理;无扩增者,考虑为CIN1级,可保守处理;FISH技术具有临床病理实用价值。何春年,荀文娟,徐名堂,徐翠清,赵焕芬,张秀智,陈琛 - 临床与实验病理学杂志文章来源： 万方数据 -
Evaluating preservation medium for the storage of DNA in African lion Panthera leo faecal samples
Talatu TENDE,Bengt HANSSON,Ulf OTTOSSON,Staffan BENSCH - 动物学报(英文版)文章来源： 万方数据 -
PCR直接测序法与ARMS检测非小细胞肺癌EGFR基因突变
目的 比较PCR直接测序法与蝎形探针扩增阻滞突变系统(amplification refractory mutation system,ARMS)检测非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)中EGFR基因突变的敏感性.方法 用直接测序发与ARMS法同时检测154例NSCLC中EGFR基因第18、19、20、21外显子的突变情况.结果 男性84例,女性70例,年龄33 ~ 86岁,手术切除标本71例、活检标本79例,其中鳞状细胞癌27例、腺癌121例、腺鳞癌2例;另4例为胸水.测序法32例突变(32/154,20.8%),ARMS法52例突变(53/154,33.8%).两种方法均检测到突变者29例,均无突变者99例,直接测序法检测到突变而ARMS法阴性者3例,反之23例,不一致率差异有显著性(P<0.000 1).结论 检测NSCLC中EGFR突变情况时,ARMS法较直接测序法操作步骤少,突变率高.宿杰阿克苏,侯英勇,刘亚岚,徐晨,张新,黄洁 - 临床与实验病理学杂志文章来源： 万方数据 -
基于荧光显色的IBV LAMP检测方法研究
【目的】建立基于荧光显色的可视化禽传染性支气管炎病毒（IBV）环介导等温扩增（LAMP）检测体系，为IBV的快速临床检测提供有力的技术支持。【方法】根据NCBI中收录的IBV 5a＋5b基因的8个区域设计了3对LAMP引物，通过对反应体系各组分和条件的优化，建立IBV LAMP检测方法，并对该方法的特异性和敏感性进行验证。分别用SYBR Green I和一定浓度比的钙黄绿素/锰离子混合物作为显色剂，对IBV LAMP检测结果进行可视化判定。应用该检测体系和PCR方法对临床送检的60份样品同时进行检测，比较2种方法的阳性检出率。【结果】成功建立了IBV LAMP检测方法，该方法能够在等温（63 ℃）条件下1 h内完成反应，具有良好的敏感性和特异性，最低可以检出1拷贝/μL的阳性重组质粒，比普通PCR方法敏感100倍，而对其他病毒检测结果均为阴性。应用SYBR Green I和钙黄绿素/锰离子显色时，阴阳性样品均有强烈的颜色对比，其中0.05 mmol/L钙黄绿素与0.6 mmol/L锰离子混合液可以用于LAMP扩增产物的判断，其结果与琼脂糖凝胶电泳结果一致。在对60份临床样本的检测中，LAMP和PCR方法检测出的阳性样本数量分别为49份和42份。【结论】建立了基于荧光显色的IBV LAMP检测方法，该方法具有在科研机构、基层实验室特别是检测现场推广和应用的潜力。张琳,马利,丁雅苓,逯茂洋,胡北侠,杨少华,张秀美 - 西北农林科技大学学报(自然科学版)文章来源： 万方数据 -
通过富集母血浆中胎儿游离DNA无创性产前诊断β地中海贫血
目的:评价富集母血浆中胎儿游离DNA的实验平台在母血浆中富集、鉴定胎儿游离DNA的适用范围.方法:(1)筛选与父源性β地中海贫血基因连锁的单核苷酸多态性(SNP)位点:利用Haploview软件对20例β地中海贫血患者(其中CD41-42型11例,IVS-II-654型9例)的β地中海贫血基因(HBB基因)进行SNP与单倍型自动化分析,检索出HBB基因内杂合度较高的SNP位点并检测与CD41-42位点及IVS-II-654位点连锁的SNP位点.(2)选取4例孕妇外周血标本,且夫妇双方为不同的β地中海贫血基因类型,利用快速耐受温度-低变性温度共扩增PCR技术(TT-FAST-COLD-PCR)检测父源性β地中海贫血基因类型为IVS-II-654型的孕妇外周血标本,若未直接检测到IVS-II-654位点,则检测仅与IVS-II-654位点连锁的SNP位点;同样的原理,利用完全耐受温度-低变性温度共扩增技术(TT-FULL-COLD-PCR)检测父源性β地中海贫血基因类型为CD41-42型的孕妇外周血标本;同时利用普通PCR技术对上述标本进行检测.结果:(1)检测出IVS-II654位点与rs7480526位点连锁9例;CD41-42位点与rs10768683位点连锁11例;(2)通过TT-FAST-COLD-PCR技术在孕妇外周血中检测出1例父源性致病突变基因(IVS-II-654位点),另外1例未直接检测到父源性致病突变基因,但检测到与其连锁的SNP位点(rs7480526位点),与羊水细胞培养检测结果一致,检出率为100%(2/2);通过TT-FULL-COLD-PCR技术在孕妇外周血中检测出2例父源性致病突变基因(CD41-42位点),与羊水细胞培养检测结果一致,检出率为100%(2/2);而普通PCR技术均未检测到上述父源性致病突变基因及与父源性等位基因连锁的SNP位点.结论:TT-COLD-PCR技术适用于富集母血浆中胎儿游离DNA突变,可用于无创性产前诊断单基因遗传病.王青青,张媛,章钧,郝秀兰,侯红瑛 - 中国病理生理杂志文章来源： 万方数据
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