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人大肠癌细胞系HCTll6中Sirt1基因敲除细胞株的构建
目的利用AAV介导的体细胞基因敲除技术,在人大肠癌细胞系HCTll6中对靶基因Sirt1进行敲除,达到基因沉默的目的.方法构建Sirtl打靶载体,通过病毒包装、感染、药物筛选、PCR鉴定、Westernblotting鉴定等步骤获得Sirt1基因敲除的细胞株.结果经过筛选和鉴定后获得两个Sirtl-/-阳性克隆,成功构建HCTll6Sirtl.一细胞系.结论通过体细胞敲除技术,我们成功地获得Sirtl敲除肠癌细胞株.贾一帆,张慧慧,王卫星,杜润蕾 - 医学研究杂志文章来源： 万方数据 -
MicroRNA-3666调节白血病细胞 PTEN 基因的表达
目的:探讨白血病细胞中microRNA-3666( miR-3666)对第10号染色体缺失的磷酸酶和张力蛋白同源基因( PTEN)表达的调控作用。方法:qRT-PCR检测miR-3666在正常人外周血单个核细胞、不同类型白血病细胞系以及临床初诊未治的不同类型白血病细胞中的表达差异,利用TargetScan在线分析软件预测miR-3666潜在靶基因PTEN后,构建含有靶基因野生型3’端非翻译区域(3’UTR)及突变型3’UTR(缺失了整段预测的miR-3666结合序列)的双萤光素酶报告基因质粒,采用脂质体Lipofectamine 2000包裹双萤光素酶重组质粒及miR-3666模拟体或阴性对照,共转染HEK293T细胞,应用双萤光素酶检测试剂盒测定萤光素酶活性。 FAM标记的miR-3666抑制体和阴性对照分别核转染至K562细胞,FACS检测转染效率,并采用 Western blotting 检测PTEN蛋白的表达。结果:miR-3666在人白血病细胞系及原代白血病细胞中的表达明显高于正常人外周血单个核细胞,尤其高表达于K562细胞系及原代慢性粒细胞白血病细胞中;双萤光素酶报告基因测定系统验证PTEN是miR-3666的潜在靶基因;K562细胞中下调miR-3666后,Western blotting检测结果显示PTEN蛋白显著上调。结论:白血病细胞中miR-3666的表达上调,下调miR-3666后可以促进靶基因PTEN的表达,miR-3666有可能成为白血病治疗的新靶点。倪芳,张玉侠,汪心怡,赵华,汪思应 - 中国病理生理杂志文章来源： 万方数据 -
pEGFP-N1-H2B1重组质粒的构建和鉴定
母胎免疫耐受作为天然的同种异体免疫耐受模型,大量研究表明,位于母胎界面的绒毛膜组织不表达经典人类白细胞抗原(HLA)Ⅰa类分子而表达非经典HLAⅠb分子(包括HLA-G等)是母胎耐受的重要机制之一.小鼠的H2B1(blastocyst MHC)基因具有HLA-G结构,其mRNA选择性表达于母胎界面,被认为是HLA-G的同源基因,研究表明blastocyst MHC以H2B1mRNA的形式能有效减栗一帆,梁志伟,姜惠敏 - 山西医药杂志文章来源： 万方数据 -
烟色红曲霉Lig4基因克隆鉴定与蛋白序列分析
为了分离鉴定烟色红曲霉中可能编码非同源重组调控因子的Mflig4基因,先后通过简并引物PCR和染色体走读方法获得烟色红曲霉Mflig4基因,采用多种分子生物学软件对其基因序列和蛋白质性质等进行分析,并构建真菌Lig4蛋白的系统发育树.结果显示,Mflig4基因包括3个内含子,位置分别为70~155,2 244~2 363,2 436~2 526 bp.Mflig4基因全长为3 120 bp,编码基因为2 823 bp.编码产物长度940 aa,蛋白质分子量为104 kDa,等电点为7.87,预测显示Mflig4蛋白在细胞中定位于细胞核中.对不同物种间Mflig4蛋白遗传进化树分析,发现烟色红曲霉的Mflig4蛋白在进化关系上与其它真菌都有较高的亲缘关系.金大勇,徐磊,曹军,刘思园 - 食品与机械文章来源： 万方数据 -
相同遗传背景结直肠腺瘤-癌组织序列 CHOP 表达与细胞增殖/凋亡比率的研究
目的:检测和探讨相同遗传背景结直肠腺瘤-癌组织序列中C/EBP同源蛋白( CHOP)表达差异及其与细胞增殖/凋亡比率( PAR)之间的关系。方法:收集23例同时具有3种病理组织学类型的结直肠肿瘤(伴低级别上皮内瘤变腺瘤、伴高级别上皮内瘤变腺瘤和腺癌)病人的手术切除标本及对应正常肠黏膜,采用免疫组织化学SABC法检测CHOP表达水平及细胞增殖指数(PI,即Ki-67阳性细胞率);采用TUNEL法检测该组织标本中的细胞凋亡指数(AI)。结果:(1)相同遗传背景条件下,CHOP在结直肠腺癌组织中的阳性细胞率显著高于伴高级别上皮内瘤变腺瘤、伴低级别上皮内瘤变腺瘤和正常肠黏膜(P<0.01);伴高级别上皮内瘤变腺瘤中的阳性细胞率显著高于伴低级别上皮内瘤变腺瘤和正常肠黏膜(P<0.01),伴低级别上皮内瘤变腺瘤中的阳性细胞率显著高于正常肠黏膜(P<0.01);(2)相同遗传背景条件下,PAR在结直肠腺癌组织显著高于伴高级别上皮内瘤变腺瘤(P<0.01)、伴低级别上皮内瘤变腺瘤和正常肠黏膜( P<0.01);伴高级别上皮内瘤变腺瘤显著高于伴低级别上皮内瘤变腺瘤和正常肠黏膜(P<0.01),伴低级别上皮内瘤变腺瘤显著高于正常肠黏膜(P<0.01);(3)相同遗传背景条件下, CHOP蛋白表达水平和PAR在伴低级别上皮内瘤变腺瘤、伴高级别上皮内瘤变腺瘤和腺癌组织中呈正相关关系(P<0.01)。结论:本实验研究了相同遗传背景下结直肠腺瘤-癌组织序列中CHOP表达水平、PAR以及两者之间的关系;随着结直肠腺瘤癌变进展,CHOP表达水平及PAR逐渐升高,且两者呈正相关关系。 CHOP和细胞增殖及凋亡异常可能共同参与结直肠腺瘤癌变过程。- 中国病理生理杂志文章来源： 万方数据 -
人类mtDNA D-Loop区位点变异对基因表达的影响
Case-Control研究表明,人线粒体基因(mtDNA) D-Loop区mt235、mt514-515、mt16183、mt16290和mt16319多态位点与有氧运动能力有关.拟从下游基因表达做进一步的研究,以探讨上述多态位点的分子调控机理.方法:采用全基因组合成法合成包含上述多态位点的DNA序列,分别连接到pGL3-promoter载体构建重组质粒,将重组质粒转染至293T细胞,观察携带5对mtDNA质粒对下游双荧光素酶报告基因的表达及荧光素酶mR-NA表达的影响.结果:携带mt235A、mt514-515CA、mt16183A和mt16319G的载体转染细胞的双荧光素酶基因表达量显著高于mt235G、mt514-515Del、mt16183C和mt16319A(P<0.01);携带mt16290两种基因型的质粒转染细胞报告基因表达没有明显差异.与pGL3-promoter载体相比,携带mt16319A的质粒转染细胞荧光素酶mRNA极显著下降(P<0.01),携带mt16290位点的两种质粒对报告基因mRNA的影响没有差异.结论:mt235、mt514-515、mt16183和mt16319多态位点影响荧光素酶基因表达,mt235A、mt514-515CA和mt16183A上调基因转录和翻译,mt16319A下调基因转录.这些基因表达上的差异可能是影响人有氧运动能力的重要调控因素.龚丽景,胡扬,李燕春,梅涛 - 体育科学文章来源： 万方数据 -
地域文化基因再现及人本观转基因空间控制理念
文化景观是环境层面上文化行为的空间产物,地域文化景观反映该地域文化体系的地理单元特征.地域文化遗产性景观揭示传统文化(尤其是心理期盼认知传统行为)在空间上传承与形制叠加的人文地理性.对后者的研究国外已借用生物传承多样性的"基因、物种和生态系统"理念去解构.诸多研究多涉及聚落景观及其基因方面,还没有全方位延伸到地域文化景观的各类型,尤其很少介入地域传统文化(风水观)遗产性基因,及其遗产景观基因的排列或组合或结构的研究.本文引用人文地理学"社会-文化"转向创立的"现象学结构主义"方法,首次系统揭示(中国)地域文化遗产(形制)基因与结构;并据后现代人本性空间观理念,即在满足遗产性景观所在地(或社区)生活空间质量需求规律下,论及提升文化产业展现内涵下的遗产景观基因再现控制理念.王兴中,李胜超,李亮,郭祎,刘娇 - 人文地理文章来源： 万方数据 -
IPO8基因启动子区rs35100176位点变异对基因表达的影响
目的:研究人importin 8( IPO8)基因启动子区rs35100176多态性位点CCT插入/缺失对基因表达的影响。方法:PCR扩增IPO8基因启动子区包含rs35100176多态位点的342 bp序列,通过测序获得了49例DNA样本的基因多态性分布。以CCT/CCT插入纯合子或-/-缺失纯合子DNA样本为模板,扩增含有不同插入/缺失序列的IPO8基因启动子片段,插入萤光素酶报告质粒pGL3-Basic,构建pGL3-3N Insertion和pGL3-3N Deletion重组表达载体。重组质粒经Fugene 6.0转染入细胞,采用双萤光素酶报告系统,检测携带不同多态性序列的重组质粒中报告基因的表达活性;real-time PCR 检测各不同基因型细胞中 IPO8 mRNA 表达。结果:通过测序发现rs35100176多态位点存在 CCT/CCT、CCT/-和-/-3种表型,其基因分布频率分别为18.37%、55.10%和26.53%。成功构建pGL3-3N Insertion和pGL3-3N Deletion重组表达载体。双萤光素酶报告基因活性检测结果显示,pGL3-3N Insertion启动下游报告基因表达的相对活性与pGL3-3N Deletion 相比显著减弱,两者存在显著差异(P<0.05);real-time PCR结果显示,CCT纯合插入的HEK293细胞中IPO8 mRNA的表达显著低于CCT纯合缺失的Saos-2细胞。结论:IPO8基因启动子区rs35100176位点的CCT碱基插入变异能显著抑制启动子活性,从而影响IPO8基因的转录。熊建军,江和,许晓源,周小鸥,王庭,李卫东 - 中国病理生理杂志文章来源： 万方数据 -
比较表观基因组学方法来研究基因组调节功能
人类基因组测序产生了大量的基因信息,但是理解每个基因的功能的目标仍未实现.比较表观基因组学(comparative epigenomics)能进行DNA和组蛋白修饰的种间比较,对起调节作用的基因组序列进行标注,该方法能确定基因的作用.- 中国农业科技导报文章来源： 万方数据 -
易感基因突变与遗传性乳腺癌的关系
随着第三代测序技术的发展,学者们对基因突变在癌症发生、发展中的作用进行了广泛的分析.特别是全基因组关联研究(genome-wide association studies,GWAS)的开展,使得学者们能够发现更多的与疾病有关的基因[1].目前,GWAS研究在识别肿瘤和疾病易感基因的研究中扮演着越来越重要的角色.除了广为研究的樊菁,吕勇刚,王廷,巫姜,崔风强,边杰芳,凌瑞 - 中华乳腺病杂志(电子版)文章来源： 万方数据
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